Hameln ist die Stadt des berühmten Rattenfängers. Weit darüber hinaus kann das Museum seinen Besucher/-innen vieles über die Fachwerkstadt an der Weser erzählen. In den Renaissancegebäuden Leisthaus und Stiftsherrenhaus beleuchtet eine neue Dauerausstellung politische Ereignisse ebenso wie den Alltag der Menschen in einer strategisch und wirtschaftlich bedeutenden Stadt. Zu den Themen gehören das Leben im Mittelalter, die Zeit der Reformation, die wirtschaftliche und kulturelle Blüte der Weserrenaissance, der Ausbau der Stadt zur Festung und die Entwicklung von Industrie und Tourismus. Ein eigener Ausstellungsbereich ist dem Rattenfänger von Hameln gewidmet. Frühe Zeugnisse geben Auskunft über die Entstehung der Sage. Ihre Rezeption wird anhand von Kunstwerken verschiedener Epochen, filmischer und musikalischer Beispiele und illustrierter Kinderbücher aus aller Welt deutlich. Besonders sehenswert ist das mechanische Rattenfängertheater, das die bekannte Erzählung in neuartiger Weise erzählt.